十六夜九衛門のロボ、カラクリキュウビに、覇王シュリケンジンがやられてしまった！地に堕ち、猛攻撃になすすべもないニンニンジャーたち。 そこに現れるラストニンジャ、好天。十六夜ＶＳラストニンジャの戦いが始まる。どうにかその場を退避した天晴たち。壊れてしまったオトモ忍……。 自分たちで新しいオトモ忍を作ることは出来るのだろうか？カラクリ技師、雑賀鉄之助の力を借りるが……。
